A Capela de São João da Ramalha encontra as suas origens num antigo oratório dedicado a Santo Antão, edificado em 1456, por iniciativa do mercador Fernão Gomes e sua mulher, Mécia Vasques Farinhas. Até ao século XVI, o local onde se implanta ter-se-á designado por Alvalade.

A capela está integrada num conjunto arquitetónico organizado em torno de um pátio de uma antiga quinta, da qual existe ainda, além da capela, a casa de habitação e o pórtico do portão, com características típicas dos séculos XVII/XVIII. Durante este período, o sítio era conhecido como Quinta dos Farinhas, e a capela passou a ser popularmente designada como São João da Ramalha. A ermida, erguida durante o século XVIII, exibe na fachada uma lápide do antigo oratório.

O espaço apenas se encontra aberto aos crentes nos dias 23 e 24 de junho, aquando da procissão em honra de São João, padroeiro de Almada, ritual que talvez tenha origem no século XV, mas que apenas foi incluído no calendário das festividades religiosas no século XVIII. Em 2010, tanto a capela como o edificado anexo foram restaurados.